结合蛋白质IMAC,肽链型IMAC, MudPIT phosphoproteomic效率分析。

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陆Cantin GT,易建联W, B,公园SK,小徐T,李JD,耶茨第三

结合蛋白质IMAC,肽链型IMAC, MudPIT phosphoproteomic效率分析。

J蛋白质组研究》2008年3月,7 (3):1346 - 51。doi: 10.1021 / pr0705441。Epub 2008年1月26日。

PubMed ID

18220336 (在PubMed

]

文摘

固定化金属亲和色谱法(IMAC)是一种常见的策略用于浓缩此处则从消化蛋白质的混合物。然而,这种策略本身是低效当分析复杂的蛋白质混合物。在这里,我们评估的有效性使用蛋白质IMAC作为预富集步骤前肽链型IMAC。最终,我们夫妻两个IMAC-based充实和MudPIT的定量phosphoproteomic分析表皮生长因子通路在哺乳动物细胞识别4470独特的此处则含有4729磷酸化网站。

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多肽

的名字	UniProt ID
英国皇家空军原癌基因丝氨酸/ threonine-protein激酶	P04049	细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶	P07814	细节
溶质载体家庭12成员2	P55011	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶A-Raf	P10398	细节
乙酰辅酶a羧化酶1	Q13085	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶催化亚基alpha -	Q13131	细节
DNA拓扑异构酶2α	P11388	细节
表皮生长因子受体	P00533	细节
CTP合酶1	P17812	细节
DNA甲基转移酶1 (cytosine-5)	P26358	细节
C-X-C趋化因子受体类型4	P61073	细节
胰岛素受体底物1	P35568	细节
连环蛋白beta 1	P35222	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶1	P06493	细节
磷脂酰丝氨酸合酶1	P48651	细节
Microtubule-associated蛋白2	P11137	细节
cGMP-inhibited 3 ', 5 '环磷酸二酯酶B	Q13370	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶7	P50613	细节
Retinoblastoma-associated蛋白质	P06400	细节
DNA拓扑异构酶2β	Q02880	细节
Wee1-like蛋白激酶	P30291	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶1	Q13233	细节
热休克因子1的蛋白质	Q00613	细节
Cation-independent mannose-6-phosphate受体	P11717	细节
耐多药resistance-associated蛋白7	Q5T3U5	细节
Uracil-DNA糖基化酶	P13051	细节
内心的着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
蛋白激酶C极微小的类型	P41743	细节
Afadin	P55196	细节
波形蛋白	P08670	细节
[3-methyl-2-oxobutanoate脱氢酶[lipoamide]]激酶,线粒体	O14874	细节
碳酸氢钠转运蛋白3	Q9Y6M7	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶2	Q9Y2U5	细节
RalA-binding蛋白1	Q15311	细节
循环AMP-dependent ATF-2转录因子	P15336	细节
TGF-beta-activated激酶1和MAP3K7-binding蛋白质1	Q15750	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
剪接因子,脯氨酸和多	P23246	细节
Desmoplakin	P15924	细节
半胱氨酸和glycine-rich蛋白质1	P21291	细节
Filamin-A	P21333	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
剪接因子1	Q15637	细节
Zyxin	Q15942	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
AP2-associated蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶激酶4	O95819	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶MARK1	Q9P0L2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶MARK2	Q7KZI7	细节
地图/微管affinity-regulating激酶3	P27448	细节
CLIP-associating蛋白1	Q7Z460	细节
Misshapen-like激酶1	Q8N4C8	细节
磷脂酰肌醇4-kinaseβ	Q9UBF8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N1	Q16512	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2	Q16513	细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2	Q15910	细节
肌醇多磷酸盐1-phosphatase	P49441	细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor类型12	Q05209	细节
受体酪氨酸蛋白激酶	Q504U8	细节
Microphthalmia-associated转录因子	O75030	细节
真核翻译起始因子4 e结合蛋白1	Q13541	细节
Runt-related转录因子2	Q13950	细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1	O60341	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节
ELAV-like蛋白1	Q15717	细节