激活血小板结构基础整合素alphaIIbbeta3钙和integrin-binding蛋白质1。
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黄H,傅高义HJ
激活血小板结构基础整合素alphaIIbbeta3钙和integrin-binding蛋白质1。
J是化学Soc。2012年2月29日,134 (8):3864 - 72。doi: 10.1021 / ja2111306。Epub 2012年2月16日。
- PubMed ID
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22283712 (在PubMed]
- 文摘
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钙和整合素结合蛋白1 (CIB1)是一个特定的绑定伙伴的胞质域alphaIIb亚基的高度丰富的血小板整合素alphaIIbbeta3。这种蛋白质被认为是参与调节alphaIIbbeta3的激活,导致血小板聚集和凝血过程。在这部作品中,解决方案结构的氘Ca (2 +) -CIB1蛋白质alphaIIb肽的复合体首次通过现代RDC-based NMR方法决定的。接下来,我们生成一个复杂结构CIB1和alphaIIb域(Ca (2 +) -CIB1 / alphaIIb)使用程序黑线鳕,基于实验限制获得蛋白质肽接口从cross-saturation NMR实验。在这个数据驱动的复杂结构,n端胞质域的阿尔法螺旋alphaIIb被埋在疏水口袋里的C-lobe Ca -CIB1 (2 +)。c端酸性尾巴alphaIIb仍非结构化和可能与几个带正电的残留的N-lobe Ca -CIB1 (2 +)。潜在的分子机制CIB1-mediated激活的血小板整合素可能的基础上,提出这种蛋白质复杂的模型结构。这项工作的另一个特点是,在NMR cross-saturation实验中,我们应用选择性射频辐射较小的约束力的合作伙伴(alphaIIb肽),并成功检测到大绑定的绑定接口合作伙伴Ca (2 +) -CIB1通过选择性地使质子化甲基。这种“反向”方法有着广泛的潜力成为了许多其他配合物合成肽和适当isotope-labeled大中型蛋白质中用于研究蛋白质-蛋白质之间的关系。